Ich gehe davon aus, dass Du Kanotix sauber neu installierst und nicht die 'alte' Partition kopierst auf den neuen PC.
Die Kopie von /home sollte nur als Kopie der Daten gemacht werden, sonst gehen vielleicht auch Präferenzen vom alten System mit, die nicht zum neuen System passen.
Die installierte Software vom alten System kann von einem Backup neu installiert werden (ist nicht von mir erfunden, hab's auch nur kopiert )
Code:
# backup softwareliste
dpkg -l|awk '/^ii/{ print $2 }'|grep -v -e ^lib -e -dev -e $(uname -r) >apps_installed.txt
# restore
apt-get install $(<apps_installed.txt)
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